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醫藥品查驗中心被衛生福利部授權，賦予提升審查品質、效率與協助生技醫藥產業解決研發問題等三項重要使命，期許經由本中心專業的審查流程，能使國人為維持健康所需之藥物使用獲得充分保障；另本中心協助經濟部與衛福部，積極給予生技醫藥業者所需之法規諮詢令台灣的生技醫藥產業朝向正面發展。
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